国際仏教学大学院大学は下記の大学と学術交流協定を締結しています。

• ハンブルク大学（ドイツ）
• EOTVOS LORAND UNIVERSITY（ハンガリー）
• オックスフォード大学（イギリス）
• カリフォルニア大学バークレー校仏教センター（アメリカ）
• 国立高等研究院（フランス）
• 法鼓文理學院（台湾）
• ミュンヘン大学（ドイツ）